蒙古族的皇后有以下几位：
孝端文皇后，博尔济吉特·哲哲，清太宗爱新觉罗·皇太极的皇后，崇德元年（1636年）册封。
博尔济吉特·孟古青，顺治帝第一任皇后，顺治八年（1651年）册封，顺治十一年（1654年）降为静妃。
孝惠章皇后，博尔济吉特氏，顺治帝第二任皇后，顺治十一年（1654年）册封。
孝哲毅皇后，阿鲁特氏，清穆宗同治帝皇后，同治十一年（1872年）册封。
义皇后，科尔沁博尔济吉特氏，顺治八年（1651年）正月，追尊为“敬孝忠恭静简慈惠助德佐道义皇后”，同年二月被追夺。
孝静成皇后，博尔济吉特氏，清宣宗道光帝皇后，咸丰五年（1855年）晋尊为康慈皇太后。
这些皇后中，最著名的是孝庄文皇后，她来自蒙古科尔沁草原，对清朝早期历史产生了深远影响。