莼菜作为水生植物，其名称因地区和用途不同而有所差异，主要别名包括：
马蹄菜
最常见的别称，因叶片形似马蹄得名。
湖菜
源自其水生环境，特指江南水乡的特产。
水葵
强调其水生特性，与睡莲科植物相关。
莼羹鲈脍
古代名菜名称，体现其作为食材的珍贵性。
屏风、淳菜、锦带、马栗草
其他地方性称呼，如四川等地称其为“屏风”。
利川红叶莼菜、西湖绿叶莼菜
特定品种名称，前者叶背红叶，后者叶背绿叶，均以口感和产地著称。
珍稀品种
如“中国莼菜之乡”利川产的福宝山莼菜，出口至日本、韩国等。
这些别名反映了莼菜在不同文化背景下的多样性，既有植物学特征命名（如“水葵”），也有因产地或食用特点得名（如“马蹄菜”“湖菜”）。