北京大学设有多个学院，涵盖文、理、工、医、经管、法科等学科领域。截至2024年9月，主要学院设置如下：
一、理学部
数学科学学院
物理学院
化学与分子工程学院
生命科学学院
城市与环境学院
地球与空间科学学院
心理与认知科学学院
建筑与景观设计学院
信息科学技术学院
电子学院
二、信息与工程科学部
信息科学技术学院
工学院
计算机科学与技术系
软件与微电子学院
环境科学与工程学院
软件工程国家工程研究中心
三、经济与管理学部
经济学院
光华管理学院
国际贸易学院
国家发展研究院
四、医学部
基础医学院
药学院
护理学院
公共卫生学院
医学人文学院
五、人文社会科学院
中国语言文学系
历史学系
哲学系
外国语学院
国际关系学院
法学院
社会学系
政府管理学院
六、教育学院
教育学系
教育财政科学研究所
新闻与传播学院
七、其他重要学部
元培学院（新型本科教育）
燕京学堂（国际交流项目）
先进技术研究院（前沿交叉学科）
分子医学研究所
海洋研究院
八、学部架构示例
理学部、信息与工程科学部、经济与管理学部、医学部、人文社会科学院、教育学院等六大学部，涵盖近100个学院及研究所。
注：部分学院如建筑与景观设计学院、艺术学院等设置较为灵活，可能随学科发展调整。建议以北京大学官网最新公布信息为准。