云南咖啡植物品种丰富，主要包含以下代表性品种：
一、核心品种
铁皮卡（Typica） 埃塞俄比亚原生品种，云南保山地区最著名的老品种，香气浓郁、风味多样，曾获“全国咖啡之冠”称号。
波旁（Bourbon）
铁皮卡衍生品种，抗病虫害能力强，适合海拔1200-2000米的地区种植，云南保山、德宏等地有广泛种植。
卡蒂姆（Catimor）
由阿拉比卡与罗布斯塔杂交培育，抗叶锈病、产量高，云南普洱地区主栽品种，豆子含水量较高。
二、其他特色品种
卡杜拉（Caturra）
卡蒂姆的近亲品种，同样具有高产抗病特性，但风味更偏向浓烈。
小粒种咖啡
因种子较小得名，实际包含铁皮卡、波旁等品种，云南小粒咖啡以滑顺口感和浓郁香气著称。
三、地域性品种
普洱咖啡： 产自云南普洱市，分为山地（海拔800-1800米）和高地（海拔1600米）两类，具有独特陈香和浓郁口感。 橡果咖啡
高地原生种咖啡：产自昆明呈贡区1600米高山，香气独特，口感柔和。
四、其他提及品种
文山壮族苗族自治州普洱咖啡：属于普洱分支，但未单独列为主要品种。
瑞丽弄贤寨咖啡：1914年引入的边民品种，现为庭院观赏植物，未用于商业种植。
总结
云南咖啡以阿拉比卡品种为主，铁皮卡、波旁、卡蒂姆为核心，兼有罗布斯塔基因的卡蒂姆品种分布最广。不同品种因种植环境差异形成独特风味，如保山小粒咖啡的滑顺与浓郁，普洱咖啡的陈香，以及西双版纳咖啡的甜润。