秦岭作为中国重要的地理分界线，拥有极为丰富的植物资源。这里生活着超过3800种种子植物，其中有不少是我国独有的珍稀植物。
主要植物种类
乔木类
太白红杉、 巴山冷杉、 糙皮桦、 红桦、 华山松、 辽东栎、 山杨、 锐齿栎、 漆树、 山核桃、 油松、 栓皮栎、 侧柏、 秦岭冷杉、 青杆、 铁杉、 槲、 栎、 短柄枹麻栎、 盐肤木、 青肤杨、 鹅耳枥、 槭类、 兴山榆、 大果榆、 华西枫杨、 连香树、 大叶林木。
灌木类
高山柳、 头花杜鹃、 金背杜鹃、 高山绣线菊、 华西银腊梅、 香柏、 忍冬类、 蔷薇类、 箭竹、 胡枝子、 六道木、 榛子。
木本藤本植物
中华猕猴桃、 清风藤、 华中五味子、 葛藤、 三叶木通、 盘叶忍冬、 串果藤、 南蛇藤、 铁线莲。
草本植物
茅草、 芦苇、 各种野生花卉、 野生中草药、 野乔杂林。
特有珍稀植物
红豆杉（植物界的大熊猫）。
珙桐（植物活化石，绿色大熊猫）。
独叶草（国家一级濒危珍稀保护植物）。
太白美花草、 五味子、 马齿苋、 星叶草、 阔萼粉报春、 冷地卫矛、 青荚叶、 陕西杜鹃、 秦岭玉兰王、 洛南古柏、 南沟七叶树、 陕西冬青王、 秦岭银杏王、 陕西红豆杉王、 陕西羽叶报春。
秦岭的植物种类繁多，其中不乏珍稀濒危的物种，这些植物不仅在生态中扮演着重要角色，也具有极高的科研和观赏价值。