明朝东北的主要城市包括：
开原：
位于辽河中游东岸，是明代万里长城最北端的路城，也是辽东最北端的城市。明朝在此设置马市，加强各民族间的贸易往来，稳定边疆形势。
辽阳：
历史上为东北首府城市，战国时期就是辽东郡治所在地。明朝初年，明军攻克辽阳，并在此兴建明城，成为东北地区政治、经济、文化、交通、军事的中心。
沈阳：
明代称为沈阳卫，是努尔哈赤从辽阳迁都后的首都，后来成为清朝的盛京奉天，即现在的沈阳市。
铁岭：
明朝设立铁岭卫，位于鸭绿江以东，是明朝的一个边防卫所。
抚顺：
明朝称为抚顺城，意为安抚顺民之意。
锦州：
古称乌桓辽西重镇。
丹东：
凤凰城，唐王东征高句丽时曾在此建立。
大连：
金州，明朝时期的重要城市。
营口：
熊岳盖州。
鞍山：
海城古称海州。
吉林：
通化集安，高句丽都城。
敦化：
敖东古渤海国。
白城：
四平的一座英雄城市。
叶赫部：
位于吉林省四平市铁西区境内。
松原：
宁江州扶余。
黑龙江：
齐齐哈尔，黑龙江将军。
哈尔滨：
阿城区，上京会宁府。
这些城市在明朝时期在东北地区的政治、经济、军事和文化方面都发挥了重要作用。