昭通苹果作为云南省昭通市特产，品种丰富且具有鲜明地域特色，主要品种包括：
一、主流品种
金帅 早熟品种，果皮底色黄绿，成熟后呈金黄色，果肉细脆且甜度高。
红富士
早熟品种，以早熟、甜度高、香味浓、口感脆著称，是昭通苹果最著名的品种之一。
华硕
中熟品种，果型端正，甜酸平衡，适合多种贮藏条件。
红露
中熟品种，果皮红润，肉质紧实，甜度高且汁液丰富。
黑卡
早熟品种，果皮深紫，果肉紧实，风味独特。
二、其他特色品种
美国8号： 早熟品种，果皮淡红，果肉脆甜，含芳香类化合物。 秦冠
昭阳绿（王林）：特色品种，果皮绿中带黄，果肉清甜。
烟富山：中熟品种，果皮红艳，果肉多汁，甜度高。
三、品种特点
昭通苹果品种覆盖早、中、晚熟及零星种植类型，共培育出近20个品种。其共同特点包括：
脆甜多汁，果香浓郁
含糖量高，风味独特
耐贮藏，适合长途运输
四、品种发展
昭通苹果品种经过多年选育，已形成以富士系列为主导的品种体系，逐渐取代了传统品种。目前，金帅、红富士等品种成为种植主体，同时积极引入新品种如美国8号、红将军等，提升产量和品质。