北京作为历史悠久的城市，明代别墅数量众多，其中最具代表性的包括以下三座：
一、清华园（明代武清侯私园）
历史背景：位于海淀区，是明代外戚武清侯（李戚畹）的私家园林，占地约1200亩，是清代畅春园的前身。
历史地位：明代北京私园中规模最大，因位于海淀镇西北而得名，与圆明园、颐和园并称“北京三大园林”。
二、勺园（米万钟私园）
历史背景：位于海淀区金鱼池畔，是明代官员米万钟的私人花园，与清华园并称“海淀双园”。
特色：园中以水景见长，金鱼池曾是明代北京重要的净水来源，园内建筑精巧，布局严谨。
三、金鱼池（明代皇家园林）
历史背景：位于海淀区，是明代皇家园林，因遍地泉水可蓄养金鱼而得名。
关联建筑：周边曾有孙承泽别业等历史建筑，现留存部分遗址。
其他相关说明
明代北京私园数量：据《北京古典园林史》记载，明代北京有七八十处私家园林，集中在积水潭、海淀等区域。
代表性园林：除上述三座外，还有梁园、居庸关等历史悠久的园林，但清华园和勺园因与清华大学关联更紧密，常被单独提及。
以上三座园林均保留了明代园林的典型特征，如因景布局、水景设计等，对后世园林发展影响深远。