玉溪市境内分布着多种珍稀植物，以下为部分代表性物种的名称及保护级别：
一、国家一级重点保护植物
滇南苏铁 国家一级重点保护植物，属裸子植物，是植物界最古老的孑遗植物之一，具有极高的科研和观赏价值。
云南红豆杉
同样为国家级重点保护植物，属于红豆杉科，木材和枝叶可入药，具有抗癌等药用价值。
伯乐树
国家一级重点保护植物，因其木材可提炼生物碱而闻名，现存数量稀少。
藤枣
国家一级重点保护植物，热带常绿乔木，果实富含维生素C。
二、国家二级重点保护植物
希陶木
2014年新发现的珍稀植物，分布于元江干热河谷，属兰科希陶木属，尚未被完全描述。
箭叶大油芒
国家二级重点保护植物，特有物种，叶片形似箭头，曾一度濒临灭绝。
火焰兰
野生火焰兰在元江县国家级自然保护区被发现，属兰科火焰兰属，因附生特性得名。
三、其他珍稀植物
紫唇姜： 未明确保护级别，但属于玉溪特色珍稀植物。 华西蝴蝶兰
四、生态保护意义
玉溪丰富的植物资源为生物多样性保护提供了重要支撑。例如，华西蝴蝶兰的发现丰富了玉溪国家重点保护野生植物种类，对抗生物多样性丧失具有积极意义。此外，希陶木、箭叶大油芒等植物的保护也体现了对特有物种的重视。
（注：部分植物如滇南苏铁、云南红豆杉等因科研价值极高，常被列为植物学研究的重点对象。）