藻类的名称因分类学的发展和形态特征的不同而有所区分，主要可分为以下几类：
一、主要分类及代表物种
绿藻门 含叶绿素a和b，多为单细胞或团块内生藻，常见于淡水及海洋环境。 - 代表物种：球藻、海带、裙带菜、绿宫廷等。
蓝藻门
细胞形态类似细菌，属于原始光合生物，部分种类可形成水华。 - 代表物种：蓝藻、海藻、水华等。
红藻门
胶囊藻属等少数种类含叶绿素a，多寄生或自由生活。 - 代表物种：角果藻、二药藻等。
其他特殊类群
金藻门： 表面有黄色柄丝，如金藻、银藻； 棕藻门
二、常见藻类名称汇总
浮游藻类：硅藻、甲藻、小球藻、巨藻；
底栖藻类：狐尾藻、裙带菜、海萝、石莼；
蓝藻类：蓝藻、蓝发菜、水华；
红藻类：角果藻、二药藻。
三、需注意的名称
部分名称存在地域性或俗称差异，例如：
海带：又称昆布、平菇，属棕藻门；
裙带菜：可耐高温，适合人工养殖。
四、历史与文化意义
“藻”在古代泛指水生植物，后逐渐特指具有光合作用的水生生物。现代分类学则根据形态、色素等特征进行细分。